氣質聯用(GC/MS)被廣泛應用于復雜組分的分離與鑒定。
質譜儀的基本部件有：離子源、濾質器、檢測器三部分組成，它們被安放在真空總管道內。
接口：由GC出來的樣品通過接口進入到質譜儀，接口是色質聯用系統的關鍵。
接口作用：
1、壓力匹配——質譜離子源的真空度在10-3Pa，而GC色譜柱出口壓力高達105Pa，接口的作用就是要使兩者壓力匹配。
2、組分濃縮——從GC色譜柱流出的氣體中有大量載氣，接口的作用是排除載氣，使被測物濃縮后進入離子源。
常見接口技術有分子分離器連接 (主要用于填充柱)、直接連接法(主要用于毛細管柱)和開口分流連接。
離子源：
離子源的作用是接受樣品產生離子，常用的離子化方式有：電子轟擊離子化、化學離子化、場致離子化和場解吸離子化、負離子化學離子化。
質量分析器：
作用是將不同碎片按質荷比m/z分開。
質量分析器類型：磁分析器、飛行時間、四極桿、離子阱等。
離子阱檢測器(ion trap detector)
原理類似于四極分析器，但讓離子貯存于井中，改變電極電壓，使離子向上、下兩端運動，通過底端小孔進入檢測器。
檢測器的作用是將離子束轉變成電信號，并將信號放大，常用檢測器是電子倍增器。當離子撞擊到檢測器時引起倍增器電極表面噴射出一些電子，被噴射出的電子由于電位差被加速射向第二個倍增器電極，噴射出更多的電子，由此連續作用，每個電子碰撞下一個電極時能噴射出2～3個電子，通常電子倍增器有14級倍增器電極，可大大提高檢測靈敏度。