一個新軟件讓CRISPR方法更加容易

　　最近，瑞典卡羅林斯卡學院和哥德堡大學的科學家，研發出了一個基于網絡的軟件——Green Listed，可以方便CRISPR方法的使用。該軟件發表在《Bioinformatics》，可以通過greenlisted.cmm.ki.se網站免費獲取。延伸閱讀：Cell最新公布CRISPR技術新發現：更多的Anti-CRISPR蛋白；張鋒2017年開年綜述：CRISPR-Cas系統——細胞的生死抉擇。

　　細胞是非常小的，并構成了一個生物體。人類身體中的細胞數量，大約相當于地球上人類數量的100倍。在絕大多數的這些細胞中是DNA長鏈。這些DNA鏈使得不同類型細胞的外觀和行為產生了差異。CRISPR可以用來快速研究“DNA的不同部分對細胞有何直接影響”。使用這種方法，研究人員可以了解疾病的原因，并給出如何治療的建議。

　　卡羅林斯卡學院醫學系分子醫學中心（CMM）的Fredrik Wermeling說：“我們使用CRISPR方法來研究免疫細胞和癌細胞。目的是為免疫系統相關疾病的患者，開發新的治療方法，如關節炎、以及癌癥。”

　　Green Listed簡化了CRISPR方法

　　CRISPR方法是基于天然存在于許多細菌的一個系統，該方法在最近幾年已經引起了廣泛的關注。使用CRISPR的一種非常行之有效的方法是，同時、平行地研究DNA的不同部分，稱為CRISPR篩選。”“Green Listed”被專門用來促進這種類型的大規模研究。

　　Fredrik Wermeling說：“在我們的研究中，通過使用CRISPR方法，我們現在可以解釋多年來試圖弄清的現象。這主要是與CRISPR篩選實驗有關，在這些實驗中我們對分離細胞中大量選定的DNA部分進行并行的修飾。Green Listed軟件大大簡化了這一過程，對于我們的研究進展是非常重要的。”

　　DNA就像一本食譜

　　DNA是研究人員經常使用的一個抽象概念。Fredrik提出了一種方法來思考DNA，即，它類似于細胞內攜帶的一份食譜。

　　Fredrik總結說：“之所以說組成個體的細胞是不同的，是因為，它們以不同的方式使用不同的食譜。在一定程度上很多疾病可以通過‘患者的DNA中存在變化’來解釋。與食譜一致的是，這可以被視為食譜中的一個或多個成分發生了改變。我們很容易想象，如果你改變食譜中的一種成分，最終產品是完全不同的，例如，從一湯匙糖到一湯匙的鹽的變化。用CRISPR方法，我們可以快速地在單個分離的細胞中做出這種變化，從而了解我們所研究的疾病。”