目前已經確定的一氧化氮合酶（nitric oxide synthase，NOS）的亞型有三種，分別有不同的基因編碼。關于NOS亞型的命名，目前有多種方式，尚無統一的規定。數字序號命名（NOSⅠ、Ⅱ、Ⅲ）是基于各亞型純化和cDNA克隆的時間先后。描述性命名是基于原型酶的細胞或組織來源以及表達方式，分別稱為神經元型NOS（neuronal NOS，nNOS）、誘導型NOS（inducible NOS，iNOS）和內皮型NOS（endothelial NOS，eNOS）。在細胞處于生理狀態下不表達，又合稱為結構性NOS（constitutive NOS，cNOS）。而iNOS初始認為其在生理狀態下不表達，在受損細胞因子等刺激后呈誘導性表達。數字式命名與描述命名的對應關系是：NOSⅠ（nNOS）、NOSⅡ（iNOS）、NOSⅢ（eNOS）。在一些特殊的細胞中，有人將NOS前直接冠以該細胞的名稱，如hep-NOS表示干細胞中的NOS，大致屬iNOS，但其對Ca2+和CaM的反應不同于經典的cNOS和iNOS。