近日,中國科學院古脊椎動物與古人類研究所研究員盧靜帶領團隊發表了一種基于開源三維可視化軟件Drishti的新方法。這種方法打破了不同三維軟件之間三維重建結果無法互通和交叉驗證的壁壘,實現不同三維可視化軟件文件的二次分割與可視化。該成果發表于《皇家學會開放科學》。
CT等三維成像技術在生物學和古生物學中應用日益廣泛,對成像數據的分割、重建和可視化工作提出了更大的挑戰。然而,不同三維重建軟件平臺之間長期存在文件不互通的壁壘,給上述工作帶來了不必要的困難。
研究團隊通過對開源三維可視化軟件Drishti進行二次開發,提出了一種新方法,解決了不同平臺上三維分割數據無法共享和二次重建的問題,促進了分割數據的互通和可驗證性。

Drishti v2.7中重新分割和可視化三維分割體數據工作流程。盧靜供圖
盧靜表示,這種新方法允許對在不同三維可視化軟件中分割的三維體數據進行進一步檢查和二次重建,對協作研究和交叉驗證三維重建結果具有重要意義。團隊以四組不同樣本和三種主流三維可視化平臺作為案例,展示了分割數據在Drishti中的無縫轉移和二次重建。這一方法也開辟了驗證分割數據準確性的新途徑。
她介紹,新方法使用了主流的圖像處理和3D可視化技術,最大程度上保持了不同軟件平臺和體數據格式之間的統一性和互操作性。它可以高效解決由于兼容性、可訪問性和經濟性問題所造成的限制和障礙,方法簡單易用,能夠廣泛應用,并保持了生成直觀視覺表現的功能,從而提高研究者之間的合作效率。通過促進不同主流三維可視化平臺之間的互操作性,該方法在準確性驗證和跨學科合作研究方面也展示了潛力,對于未來高效、精準地重建和渲染化石和其他生物材料掃描所得的三維體數據具有重要意義。
據悉,該研究已經應邀參加美國NoCTURN(非醫學CT掃描數據)計劃,將進一步推動三維分割、重建效率的提高以及科學研究數據的共享。
相關論文信息:https://doi.org/10.1098/rsos.240375
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