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  • 發布時間:2020-04-21 18:25 原文鏈接: 不同品牌游離核酸保存管的比較(二)

    圖 4Qubit 結果顯示: 三種保存管 7 天內保存效果無明顯差異, 14 天時, K 組與 S 組保存管均出現明顯的上升,分別是第 0 天的 15.27 倍和 10.21 倍, 21 天時,上升最為明顯,分別是第 0天的 22.46 倍和 13.84 倍。 B 組保護劑保存的血液在第 0、 3、 7、 14、 21、 28 天檢測時, 每毫升血液 cf-DNA 濃度均無明顯的上升。

    圖 5Beta-actin 絕對定量結果與圖 4 基本一致。 B2 組保護劑保存的血液在第 0、 3、 7、 14、21、 28 天檢測時, 每毫升血液 Beta-actin 拷貝數均無明顯的上升。

    3.2 不同天數下(4°C)游離核酸保存效果的對比

    圖 6Qubit 結果顯示: 在 4°C 情況下, 三種保存管 0-14 天的每毫升血液 cf-DNA 濃度并無明顯的差異。

    圖 7Beta-actin 結果顯示:在 4°C 情況下,三種保存管 0-14 天的每毫升血液 Beta-actin 拷貝數并無明顯的差異。

    3.3 不同天數下(37°C)游離核酸保存效果的對比

    圖 8Qubit 結果顯示:在 37°C 情況下,三種保存管 0-14 天的每毫升血液 cf-DNA 濃度并無明顯的差異。

    圖 9Beta-actin 結果顯示:在 37°C 情況下,三種保存管 0-14 天的每毫升血液 Beta-actin拷貝數并無明顯的差異。

    3.4 運輸環境(25°C)對游離核酸保存效果的影響

    考慮到保存管有可能應用于樣品的長途或短途運輸,因此需用搖床模擬運輸環境對保護劑抑制細胞破裂的影響。 S 組、 K 組及 B 組分別采集血液一份,搖床設置 180rpm, 25°C,分別在 0、 3、 7、 14 天檢測核酸濃度和 beta-actin 拷貝量。

    圖 10Qubit 結果顯示:在 25°C 模擬震蕩情況下,三種保存管 0-14 天的每毫升血液 cf-DNA濃度并無明顯的差異。

    圖 11Beta-actin 結果顯示:在 25°C 模擬震蕩情況下,三種保存管 0-14 天的每毫升血液Beta-actin 拷貝數并無明顯的差異。

    4.討論

    (1)從每毫升血液 Beta-actin拷貝數及每毫升血液 cf-DNA濃度兩個方面來驗證 cf-DNA完整性,已在多篇文獻中[4][5]得到驗證。
    (2) 室溫 25°C 下,保存 3 天時, 3 種保存管的差異不顯著;保存第 7 天時, E 與 B 組間的差異極顯著, B 與 S 組差異具有顯著性;保存第 14 天時, B 與 S 組 P value<0.01,差異極顯著。 在室溫 25°C 下, B 組較 S 組及 E 組,保存時間較長,效果較佳。
    (3)室溫 25°C 下,三種保存管 7 天內保存效果無明顯差異, 14 天時, K 組與 S 組保存管均出現明顯的上升,, 21 天時,上升最明顯。 B 組保護劑保存的血液在第 0、 3、 7、 14、 21、 28 天檢測時,每毫升血液 cf-DNA 濃度均無明顯的上升。 在室溫 25°C 下, B 組較 S 組及 K 組,保存時間較長,效果較佳。
    (4)在 4°C 情況下,三種保存管 0-14 天的每毫升血液 Beta-actin 拷貝數及每毫升血液 cf-DNA濃度并無明顯的差異。 在 4°C 下, B 組、 S 組及 K 組,保存效果無明顯差異。
    (5)在 37°C 情況下,三種保存管 0-14 天的每毫升血液 Beta-actin 拷貝數及每毫升血液 cf-DNA濃度并無明顯的差異。 在 37°C 下, B 組、 S 組及 K 組,保存效果無明顯差異。
    (6) 在 25°C 模擬震蕩情況下,三種保存管 0-14 天的每毫升血液 Beta-actin 拷貝數及每毫升血液cf-DNA 濃度并無明顯的差異。 在 25°C 模擬震蕩情況下, B 組、 S 組及 K 組,保存效果無明顯差異。

    5.參考文獻

    [1]MANDEL P, MéTAIS P. Les acides nucléiques du plasma sanguin chez l’homme [J] . C R Acad Sci Paris, 1948,142: 241-243.
    [2]LEON S A, SHAPIRO B, SKLAROFF D M, et al. Free DNA in the serum of cancer patients and the effect of therapy [J] .Cancer Res, 1977, 37(3): 646-750.
    [3]STROUN M, ANKER P, MAURICE P, et al. Neoplastic characteristics of the DNA found in the plasma of cancer patients[J] . Oncology, 1989, 46(5): 318-322.
    [4]Norton S E, Lechner J M, Williams T, et al. A stabilizing reagent prevents cell-free DNA contamination by cellular DNA in plasma during blood sample storage and shipping as determined by digital PCR[J]. Clinical Biochemistry, 2013, 46(15):1561-5.
    [5] Ryan W L, Fernando R M, Das K. BLOOD COLLECTION DEVICE FOR STABILIZING CELL-FREE PLASMA DNA:, WO 2013123030 A3[P]. 2013.


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