不同類型色譜柱的分離原理及應用情況
| 柱類型 | 主要種類 | 分離原理 | 應用對象 |
| 吸附 | 硅膠，氧化鎂，活性炭 | 基于溶液對固定相吸附能力的差異而分離 | 極性不同的化合物 |
| 分配 | 乙二醇，硝基甲烷，甲基聚硅氧烷 | 基于溶液在流動相和固定相之間分配系數差異而分離 | 烷烴、烯烴、芳烴、稠環、染料、甾族等化合物 |
| 反相 | 正十八烷，正辛烷，正丁烷，甲烷，苯基 | 基于溶液疏水性不同導致溶質在流動相和固定相之間分配系數差異而分離 | 大多有機物，多肽、蛋白質、核酸等生物大、小分子，樣品一般溶于水中 |
| 正相 | SiO2，CN，NH2 | 基于溶液極性不同導致在極性固定相庫侖作用力的差異進行分離 | 中、弱和非極性化合物，一般溶于有機溶劑 |
| 離子交換 | 磺酸基，季黯基 | 溶質電荷不同及溶質與離子交換固定相庫侖作用力的差異進行分離 | 離子和可離解化合物 |
| 凝膠 | 凝膠滲透，凝膠過濾 | 基于分子的相對分子質量及尺寸不同使得溶質在多孔填料體系中滯留時間差異進行分離 | 可溶于有機溶劑或水的任何非交聯型化合物 |
| 疏水 | 丁基，苯基，二醇基 | 溶質的弱疏水性及疏水性對流動相鹽濃度的依懶性使溶質得以分離 | 具弱疏水性及弱疏水性隨鹽濃度而改變的水溶性生物大分子 |
| 親和 | 種類較多，如生物特效，燃料配位 | 溶質與填料表面配基之間的弱相互作用力即非成鍵作用力所導致的分子識別現象進行分離 | 多肽，蛋白質，核酸等生物分子及可與生物分子產生親和相互作用的小分子 |
| 手性 | 手性色譜 | 手性化合物與配基間的手性識別 | 手性拆分 |