對生物過濾器的挑戰實驗是向帶正電的過濾器進水中不斷注入高含量的內毒素，然后采用鱟變形細胞溶解物試驗（動態濁度法）測量產水中的內毒素濃度。
大多數的內毒素挑戰實驗均要使用凈化的LPS。 ELGA LabWater的科研團隊從純水中已有的細菌中生產出自己的LPS。 這是為了模仿逼真的挑戰實驗環境。
首先從純水中分離出細菌。然后將細菌接種到蛋白胨水中，在27℃的溫度下培養。對樣品反復進行加熱處理，用0.45μm過濾膜進行過濾，由此得到濃縮的內毒素。
每個挑戰實驗持續5分鐘，得出以下總挑戰實驗結果：即使挑戰實驗超過了90 EU/ml，總挑戰實驗接近800000 EU，在生物過濾器后的產水中也未能檢測出內毒素（<0.001EU/ml）。
實際上，過濾器的進水中內毒素的含量極低（<0.1EU/ml）。為了更逼真地模仿實際情況，以內毒素含量為1EU/ml（標稱）的純水做進水，對生物過濾器做長時間的測試：在流過800升后仍未能檢出內毒素（<0.001EU/ml）。
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