中醫學是整體醫學而不是局部醫學，是動態醫學而不是靜態醫學，是功能態醫學而不是形態（解剖）醫學，因而有著自身獨特的診治及預防疾病的原理。
中醫診斷疾病的基本原理
診斷就是診察了解、分析判斷的過程。醫學診斷是醫生的認知活動過程。不同的醫學診斷活動，有著各自不同的診斷依據、原理和方法。
（一）中醫認識疾病發展的基本理論模型
1.“邪正相爭”——最基本的病變發展演變規律
正常人體，“正氣存內，邪不可干”。病變之時，“邪之所湊，其氣必虛”。正氣是一切抗病因子和因素的總和，邪氣是一切致病因子和因素的概稱。
“邪正相爭”導致出現“邪正盛衰”的變化，隨著這種變化，可出現：正勝邪退，則病愈，或病情漸輕，向愈；邪盛正衰，則病重，或病情漸重，惡化。
2.陰陽失調——常人變為病人的關鍵
正常之人，“陰平陽秘，精神乃治”。病變之時，人的陰陽失衡而出現陰陽盛衰，陽盛則陰病，陰盛則陽病；陽盛則熱，陰盛則寒；陽虛則寒，陰虛則熱。
3.氣機逆亂——病變之人氣機（功能）運行的狀態及其規律
正常人體，氣機的升降出入正常有序，升清降濁，氣血條暢，五臟六腑通泰，四肢百骸得養，內外整體和諧，使得“陰平陽秘”而“正氣存內，邪不可干”。病變之時，氣機的升降出入紊亂甚而逆亂，清者不升、濁者不降，“毒”邪內積；五臟六腑不調，四肢百骸失養，內外整體不和，則病變由生。
（二）中醫診病的基本原理與方法
1.以人體“藏于內，現于外”的“藏象”為依據和信息源
中醫診察了解疾病，可以不打開人體，不依賴解剖學知識和現代儀器，僅用望、聞、問、切“四診”，靠醫者的感覺器官，就能從人體外部獲知人體內部變化的信息，進而查知其內部變化。
中醫應用望、聞、問、切方法收集到的信息，就是從整體入手，收集和辨別人“藏于內，現于外”的“藏象”信息。如是，“藏象”就成為中醫診察了解、分析疾病的最基本的信息依據和來源。
2.“藏象”是人整體生命活動的具體反應信息
中醫理論認為“藏于內之臟，必有形于外之象”，“有諸內，必形諸外”。因此，通過察外現之“象”，即可知內在之“藏”的變化。其原因和依據在于：
其一，人體以居于內的“五臟”為中心，通過經絡，內連六腑、奇恒之腑，外連經脈、骨肉、皮毛，形成一個互為表里、如環無端、陰陽互根、氣血流暢、內外互通的有機整體。
其二，人與外界的自然環境、社會環境息息相關，內外互通。人體內外聯系互動的生命活動過程，也是人體功能活動的過程，產生著大量的信息，發生著交流運動，形成生命活體的“功能態”信息而表現于外，從人體外可征可知。
其三，對“藏于內”而“現于外”的生命活體的“功能態”信息進行辨別分析的方法，蘊含和運用了現代控制論的“黑箱”理論原理。
3.察“象”知“藏”是中醫診病的根本途徑
中醫學對人體的認識不以解剖學的還原分析為主，而是以整體綜合性地收集分析“藏于內、象于外”，“有諸內、必形諸外”的“藏象”為依據。
察外現之“象”而知內在之“藏”，就是通過分辨“藏于內、形于外”的人體“功能態”信息，診病變化。依據分辨“功能態”信息診病，其實質就是應用“生物信息學”原理診病。
4.“以常衡變”是中醫診病的基本標準與參照方式
中醫學認為，萬事萬物均由“陰陽”構成，均有“常”與“變”。天、地、人、事之“常”即為“陰平陽秘”，天、地、人、事之“變”即是“陰陽失衡”，或“陰盛陽衰”，或“陽盛陰衰”，甚則“陰陽離絕”。因此，以“陰平陽秘”所形成之“常”，衡量評價評判“陰陽失衡”所致之“變”，即為中醫診病的基本標準與參照方式。
“常”，即為常規、常理、常識、常量，具有相對性與廣泛性。
“變”，即為變化、改變、異常。細細分辨，又有“常中之變”與“異常之變”的不同。
5.“司外揣內”與“見微知著”是中醫診病的基本方式
中醫根據“有諸內，必形諸外”的藏象依據，通過察“象”知“藏”的根本途徑，依據外在的“象”，綜合分析推知揣測內在之“藏”的生理病理變化。
“司外”，就是緊緊地全面地抓住并分析人體內在之“藏”表現于外的“象”；“揣內”，就是依據外在之“象”，全面分析推知揣測內在之“藏”的狀況。
“見微知著”蘊涵著“生物全息”的原理，揭示和反應出中醫診病整體分析的內在聯系。中醫認為，整體變化源于局部的變化，局部可顯整體。這蘊涵著“生物全息”的原理。如：全身的氣血、經氣的運行，可在某一些特定局部反應出來。如：脈象、舌象等。
6.整體診察與望、聞、問、切四診合參
在整體觀的指導下，中醫既把握住人的整體聯系，又注意分布位診察，以全面收集病情資料；既分別運用望、聞、問、切四種診法診察病情，又強調將望、聞、問、切四診的認識合參，印證、校驗其真實性和有效性，以確保診察結論的可靠性和全面性。