中科院微生物所在細菌耐藥基因組學研究獲進展

　　 中科院微生物所朱寶利課題組在細菌耐藥基因組學研究中的最新進展，研究首次以基因組學大數據為依托，深入解析了耐藥基因在細菌間的傳播網絡和規律，對深入認識細菌耐藥性的進化、細菌耐藥的形成機制等具有重要意義。成果近日在線發表于《應用與環境微生物學》，并將于第82卷22期以“封面故事”形式發表。副研究員為胡永飛第一作者，朱寶利研究員為通訊作者。

　　細菌耐藥是全球公共健康所面臨的重要挑戰。近年來，隨著攜帶NDM-1、MCR-1等耐藥基因的“超級細菌”的不斷出現，問題日益突出。細菌具有多種耐藥機制，由大量耐藥基因所編碼。然而，耐藥基因，尤其是具有高風險等級的可移動性的耐藥基因，在細菌及人體和動物腸道菌群間的傳播網絡及傳播驅動力并未得到完全揭示。近來，課題組胡永飛等對23000余個已知細菌基因組、980萬個已公布人體腸道細菌基因、測序獲得的30萬個養殖動物腸道細菌基因中的高風險等級可移動性耐藥基因進行了全面分析。

　　此項研究發現，可移動性耐藥基因主要存在于4個細菌門當中的790個細菌種之中，其豐度和轉移頻率在變形菌門中顯著富集。這些耐藥基因在細菌間的近期轉移形成了一張巨大的網絡，由703個細菌種、16859個種間配對所組成。對該網絡進行解析，發現細菌個體間耐藥基因的轉移由細菌種屬進化關系所主導，又同時受制于生態屏障；這一規律同樣適用于耐藥基因在人體和動物腸道細菌群體水平上的轉移。進一步分析發現，41個人體和動物腸道菌群間相互轉移的耐藥基因中的33個存在于多種人體病原細菌中。