中科院微生物所等在油棕基因組學研究獲進展

　　 中科院微生物所葉健課題組與中科院外籍院士、美國洛克菲勒大學教授蔡南海和新加坡淡馬錫生命科學研究院教授岳根華等人合作，完成了高產母本厚殼Dura基因組的高質量的序列測定和多個種質資源的基因組重測序以及進化分析。研究為油棕分子輔助育種和基因組編輯抗性育種工作奠定了堅實基礎，對日趨競爭激烈的全球食用油、生物燃料生產和保護熱帶雨林等產生積極的影響和作用，對保障我國的食用油安全具有重要意義。相關成果近日發表于《基因研究》。

　　油棕是世界上產油率最高的熱帶木本油料作物之一，以5%的種植面積生產世界上45%的植物食用油脂，享有“世界油王”之稱。它還是生物燃料的理想原料來源，產出的能量是栽培所需消耗能量的9倍。我國是全球棕櫚油最大的消費國之一，幾乎全部依靠進口，進口量約600萬噸，迫切需要加快油棕產業和基礎科研的發展。且由于油棕種質資源匱乏，導致商業用品種遺傳背景單一、抗源缺乏，狹長孢靈芝等大型真菌病害引起的根腐和莖腐病造成大片輪作油棕地塊毀園絕收的嚴重病害流行。但由于缺乏基因組數據，無法應用現代育種技術。

　　合作團隊對東南亞重要的高產母本厚殼Dura材料進行全基因組隨機測序，組裝出1.701Gb、覆蓋基因組95%以上區域的高質量序列草圖，并且對油棕主要組織器官進行深度轉錄組測序，注釋出近36105個高度可靠的油棕基因。由此建立的基因表達譜覆蓋了油棕大部分的自然生長階段，特別是包括了受狹長孢靈芝侵染不同階段的油棕根部基因表達數據，為油脂合成及調控基因功能研究和抗病高產育種提供了重要基因組和表達譜分析數據。通過對其他來源于非洲和美洲不同區域的油棕Dura品種的再測序，研究人員獲得了1800萬個SNP（單堿基多態性位點），并在基因組中定位了其中的1萬個SNP分子標記。在油棕基因組中鑒定出了566個抗性基因（R基因）。