壓力蒸汽滅菌采用濕熱滅菌法，在同樣溫度下，濕熱的殺菌效果比干熱好，有以下原因：
蛋白質凝固所需的溫度與其含水量有關，含水量越大，發生凝固所需的溫度越低。濕熱滅菌時的菌體蛋白質可吸收水分，因而比在同一溫度的干熱空氣中更易于凝固。
濕熱滅菌過程中蒸汽放出大量潛熱，進一步提高溫度。在同一溫度下，濕熱滅菌所需時間比干熱短。
濕熱氣體的穿透力比干熱氣體強，故濕熱比干熱收效好。高壓蒸汽可以殺死一切微生物，甚至包括細菌的芽孢，真菌的孢子等耐高溫的個體。滅菌的蒸汽溫度隨蒸汽壓力增加而升高，通過增加蒸汽壓力，滅菌時間可被大大縮短。因此它是一種最有效，使用最廣泛的滅菌方法。