在乙肝e抗原轉陰后數月出現乙肝e抗體陽性。一般來說，乙肝e抗體陽性預示患者的傳染性已顯著或相對降低。病毒復制程度已降低或明顯緩解。近年發現許多乙肝e抗體陽性，但乙肝病毒脫氧核糖核酸（HBVDNA）亦為陽性的異型乙肝患者，其病情遷延不愈。這是感染了變異的乙肝病毒所致，臨床上不可忽視。但也有學者認為乙肝e抗體的產生，只意味著乙肝病毒大部分被清除，但并不意味著慢性肝炎的痊愈。
乙肝e抗體并不是一種保護性抗體，e抗體的出現一般代表著乙肝病毒復制減少或已基本停止。如果乙肝患者出現e抗體陽性也不能掉以輕心，需要根據乙肝HBV-DNA檢測做進一步的判斷。
乙肝e抗體陽性的患者，如果HBV-DNA檢測陰性則說明體內乙肝病毒復制減少，傳染性弱；如果HBV-DNA檢測為陽性，則說明體內還存在病毒大量復制，有可能是病毒變異的結果，需要做進一步的治療。
