乙酰膽堿可以影響植物的膜脂代謝。如它可以抑制磷摻入到黃化大豆莖切段的磷脂分子中,但在有氧條件下主要抑制磷摻入磷脂酰乙醇胺和磷脂酰膽堿,而在無氧條件下乙酰膽堿主要抑制磷摻入磷脂酰肌醇。這些結果表明植物的磷脂與動物的磷脂間有相似性,乙酰膽堿可以同樣影響植物的磷脂代謝。