乳化劑在養殖行業主要用于養殖飼料的改性。在畜禽水產養殖中，為了加快動物的生長速度、提高動物的生產性能、降低料肉比，在飼料中普遍使用乳化油脂。這樣一來，消化高比例的油脂所需要的膽汁酸鹽量超過了畜禽體內的分泌量，造成飼料不消化及脂肪在肝臟的積累。為此，選擇適合的飼料乳化劑成為乳化劑在養殖行業應用中的關鍵。2017年，在畜禽水產養殖中使用較多的是離子型的膽汁酸鹽類和卵磷脂類乳化劑，這類乳化劑主要功能是保肝利膽、調節肉質，但其乳化效果并不理想。而非離子型飼料乳化劑能取得更高的乳化性，如單硬脂酸甘油酯、蔗糖脂肪酸酯等。同時，能夠加速油脂裂解的脂肪酸酶作為添加劑加入到飼料乳化劑中的應用也逐漸增多。