隨著臨床級新一代測序(NGS)方法的逐漸成熟,使用組織和來自血液的ctDNA評估腫瘤患者基因改變成為可能。最近來自美國加州大學醫學院的研究檢測了62名晚期乳腺癌患者的ctDNA,其中38名患者還有組織的NGS測序結果。
對比這些結果發現,ctDNA的NGS檢測結果中能夠發現腫瘤相關的基因改變,最常見的是TP53和PIK3CA基因的改變,還會觀察到EGFR的擴增。當ctDNA與組織的采集時間相差小于6個月時,兩者之間的一致性更高。此外,ctDNA定量檢測還能提供患者的預后信息,基因改變的程度與生存時間有關。

乳腺癌可能是最早出現“靶向”治療的腫瘤之一,比如通過切除卵巢和藥物拮抗治療激素受體陽性的乳腺癌患者,對HER2陽性的患者使用相應的抗HER2治療。隨著越來越多腫瘤相關基因改變的發現,腫瘤的精準治療時代漸漸到來,最近的NGS技術的出現,更是大大推動了這一進程。最近的NGS技術主要基于組織以及ctDNA,來自美國加州大學醫學院的研究探索這兩種技術對于乳腺癌治療的意義。
研究納入了62名晚期乳腺癌患者,她們之前接受治療的中位數量為5種。62名患者有基于ctDNA的NGS檢測結果,檢測了54-70個不等的基因,其中38名患者還有組織NGS檢測結果,檢測了236-315個不等的基因。在ctDNA的檢測結果中有42名患者具有特征性的改變,而組織NGS則在37名患者中檢測出了有意義的改變。

ctDNA和組織NGS中檢測出的腫瘤相關的基因改變
ctDNA的檢測結果中,中位的有意義改變基因數量為1個(范圍 0-7個),其中最為常見的是TP53(37%)和PIK3CA(23%)基因的改變。組織的檢測結果中,中位的有意義改變基因數量為4個(范圍 0-17個),其中最為常見的也是TP53(37%)和PIK3CA(24%)基因的改變。此外,在11%的ctDNA 患者中還檢測到了EGFR基因的擴增,這一基因改變在組織的檢測結果中并不存在。

組織和ctNDA的NGS檢測結果稍有差異
比較ctDNA以及組織NGS的檢測結果發現,當兩個樣本的采集、分離時間小于6個月時,兩者之間的一致性會更好。ctDNA能夠檢測到48%在組織中檢測到的改變,而在組織中則能檢測到ctDNA中48%的改變。在排除了ER和ERBB2 改變,僅考慮其他具有可能臨床意義的改變時,兩者結果之間的重疊比例可以達到66%和95%。研究人員認為兩種檢測方法之間的差異可能與取樣的時間間隔以及腫瘤異質性有關。

ctDNA定量分析能夠提供患者的預后信息
進一步的研究考慮到了ctDNA的定量檢測結果。分析發現,如果ctDNA的檢測結果中基因改變的較多的患者往往預后會更差。具體而言,對于存在大于1個基因改變占ctDNA>5%的患者而言,其生存期就會較基因改變占ctDNA<5%的患者明顯縮短(6.7月 vs 17.9月; P=0.01)。
研究人員認為,這兩種技術能夠提供互補的結果并對患者的預后有一定的提示作用。接下去應該開展前瞻性的隊列研究對比兩種技術的檢測結果并評估它們對于患者預后的影響,從而為乳腺癌的患者的治療決策提供更多有效的信息。
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