乳腺Paget‘s病的組織發生有兩種解釋，一是來源于乳腺大導管內的導管上皮，二是由乳頭扁平上皮原位起源。認為來源于大導管的根據是乳腺Paget’s病絕大多數患者都伴有乳腺內腫塊，且這些腫塊的病理結果90%是乳腺浸潤性癌，即使乳腺體檢時未發現腫塊，術后病理也可發現導管內癌。又Paget‘s細胞的分子生物學因子的表達與乳腺實質內的乳腺癌相似。認為來源于乳頭上皮的根據是盡管大多數乳腺Paget’s病伴有乳腺內乳腺癌，但仍有一部分患者僅僅表現為單純的乳頭病變，對伴有乳腺內乳腺癌的患者，有部分病例的病理學提示與乳頭病變不連續。另外，通過對Paget’s細胞的超微結構觀察發現，Paget‘s細胞具有由乳頭扁平上皮細胞原位形成的可能性。