李紀恒強調，要緊扣目標，抓住關鍵，推動九湖水污染綜合防治工作邁上新臺階。一要堅持“一湖一策”。根據九大高原湖泊不同的環境問題及其成因，確定針對性強的治理方向、重點和難點，把握共性、突出個性、分類治理，真正實行“一湖一策”，達到既治標又治本的目的。
二要建立和完善以工業污染防治、城鎮污水治理、農村農業面源污染控制為主的湖泊污染控制體系，以“四退三還”工程、湖濱濕地、湖濱生態廊道、水土保持和植樹造林為主的湖泊生態保護體系，以湖泊科研、監測、監察、宣教機制為主的湖泊環境監管體系，以領導管理體制、良性工作機制為主的湖泊環境領導責任體系，實現從專項治理向綜合治理轉變。
三要多渠道籌措資金。積極探索“政府推動、多元投資、市場運作”的路子，著力構建投資主體多元化、運營主體企業化、運行管理市場化的投融資體系，吸納社會、企業、個人資金及外資投入九湖保護與治理。
四要轉變發展方式。大力發展綠色經濟、低碳經濟、循環經濟，嚴格環境準入，實行高原湖區工業發展“環保一票否決”制，大力發展生態農業，重視發展生態旅游文化產業，加快發展生態城鎮，促進產業結構調整和發展方式轉變，從源頭控制污染，使湖泊水質從根本上得到保護。