顯微結構是指在光學顯微鏡下可以觀察到的結構.
對于細胞來說：細胞壁、細胞核、內質網、線粒體、葉綠體、高爾基體等是可以直接在光學顯微鏡下觀察到外觀形狀的,屬于顯微結構；
注意只能看到細胞器的形狀,內部詳細結構是看不見的.比如葉綠體只能看到是綠色的橢圓形顆粒,里面的基粒屬于亞顯微結構.
亞顯微結構是指在電子顯微鏡下可以觀察到的結構.
對于細胞來說：細胞膜、核糖體、各種膜結構,以及各種細胞器的內部詳細結構,屬于亞顯微結構.
所以,高倍鏡（是屬于光學顯微鏡,顯微結構）可以看到染色體.
而染色質是看不到的,要在電子顯微鏡下看的到.
染色質高度螺旋成為染色體,染色體經過堿性染料染色后可以在高倍鏡下觀察到.
電子顯微鏡下看到的是亞顯微結構，光學顯微鏡下看到的是顯微結構電子顯微鏡放大倍數遠遠大于光學顯微鏡，光學顯微鏡只能看到細胞的基本結構（細胞壁、細胞膜、細胞質、細胞核）、極少數細胞器（葉綠體、染色后的線粒體）還有染色后的染色體等，而電子顯微鏡可觀察到細胞內的幾乎任何結構。
光學顯微鏡和電子顯微鏡的區別是：光學顯微鏡只能看到某些細胞結構，如細胞壁、葉綠體、染色后的染色體、線粒體、細胞核等，電子顯微鏡可以看到細胞器的內部結構以及象核糖體這樣較小的細胞器。總之，光學顯微鏡看到細胞的顯微結構，電子顯微鏡可以看到亞顯微結構。