慢性腸炎泛指腸道的慢性炎癥性疾病，其病因可為細菌、霉菌、病毒、原蟲等微生物感染，亦可為過敏、變態反應等原因所致。臨床表現為長期慢性、或反復發作的腹痛、腹瀉及消化不良等癥，重者可有粘液便或水樣便。
本病可由急性腸炎遷延或反復發作而來，病程多在2個月以上。長期過度疲勞、情緒激動、過度精神緊張，加以營養不良，都可成為慢性腸炎的誘因。也可繼發于咀嚼障礙、胃酸缺乏、胃大部切除術后、腸道寄生蟲病等疾患。
