水是一種其分子由分子間氫鍵連接起來的溶劑。在有離子存在時，水就使它們溶劑化，如圖1所示。然而，碳氫化合物微溶于水而不被它溶劑化。因此，水分子由于非極性區域的存在而更有秩序地排列，并較被其它水分子完全包圍時處于較高能級。這樣，在內部介質中，兩個非極性鏈的相互作用（例如，一個（A）屬于某一機體的生物大分子，另一個（B）屬于一個和它成鍵以產生藥理作用的藥物分子）通過原來存在于兩鏈間區域的水的退出而減小接觸面。結果從與非極性面接觸被置換出來的水分子成為無秩序的水的排列上的紊亂引起體系內熵的增加，并由此而減少自由能，使兩個非極性區域間的接觸穩定化，這種締合作用稱為疏水性鍵或疏水性相互作用。它是已知為疏溶劑性力的普遍現象中的一種特例。疏溶劑性力中以疏水性力為最大，因為在一般惰性溶劑中，水的表面張力最大。
在極有利于復合物形成的疏水性相互作用過程中，每一H2C…CH2—相互作用釋放0.7千卡/克分子的自由能。生物大分子（例如酶）在其表面有非極性鏈。很多藥物分子在其結構中也有非極性區域。上述兩例中這些鏈可以是芳基或烷基。因此可以預期，疏水性力介入生物大分子——藥物復合物的形成，而且可以達到可觀的程度。疏水性力也發生于極性基團中，例如在瞟呤和嘧啶堿中。事實上對于某些酶已由實驗所證明。