顯微拉曼光譜儀就是把 拉曼光譜儀+標準的光學顯微鏡 耦合在一起。激發激光束通過顯微鏡聚焦為一個微小光斑，這就是顯微的意思。這一光斑所在范圍內的拉曼信號通過顯微鏡回到光譜儀，然后得到光譜信息。但是僅僅給拉曼光譜儀添加顯微鏡并不能控制采集特定體積內樣品的拉曼信號——要實現這個目標必須增加空間濾波器。共焦顯微拉曼光譜儀可以實現在橫向（XY平面內）以及縱向（Z 方向）的空間濾波功能，從而控制采集某特定體積內樣品的拉曼信號。現在實現空間濾波的方法有幾種，例如通過共聚焦針孔實現的真共焦以及通過狹縫實現的贗共焦等。真共焦設計在光路上安裝完全可以調節的共焦針孔光闌，可以達到微米量級的縱向分辨率，可以逐層分析多層薄層樣品，即可以在縱向進行拉曼切片。