婦科疾病：如外陰及陰道念珠菌病、花斑癬、皮膚真菌病、真菌性角膜炎和口腔念珠菌病等。
皮膚科/眼科疾病：包括皮膚癬菌和（或）酵母菌引起的甲真菌病，以及皮膚、毛發、甲板、黏膜的真菌感染。
系統性真菌感染：包括系統性曲霉病及念珠菌病、隱球菌病（包括隱球菌性腦膜炎）、組織胞漿菌病、孢子絲菌病、巴西副球孢子菌病、芽生菌病和其他各種少見的系統性或熱帶真菌病。
其他非真菌感染：伊曲康唑還可用于治療難治性或復發性呼吸道感染、腫瘤相關性發熱、HIV/AIDS患者的口腔和食管念珠菌病，以及血液系統腫瘤患者預防侵襲性真菌感染。