體積最小的Illumina測序儀在剛果民主共和國一展身手

　　美國陸軍傳染病醫學研究所（US Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, USAMRIID）的Mike Wiley和Catherine Pratt把他們的iSeq和其他8箱實驗室設備一起裝進Pelican安全箱，從埃塞俄比亞飛往剛果民主共和國（DRC）的金沙薩。此時剛果正爆發埃博拉病毒病（Ebola Virus Disease, EVD），死亡人數急速上升，時間十分緊迫，無暇他顧。為免在海關受阻導致延誤，Wiley選擇了隨身攜帶測序儀。在狗狗們圍著他的“旅行實驗室”嗅來嗅去、對他的試劑和耗材展示出濃厚興趣時，他在一旁耐心等候。他順利通過機場，在抵達目的地數小時后，在總干事Jean-Jacques Muyembe博士的帶領下，于國家研究生物醫學研究所（Institut Nationale de Recherche Biomédical, INRB）裝設了一個功能齊全的測序設施。他接通iSeq的電源，進行系統檢查，然后立即開始處理樣本。

　　除了少數幾次因實驗室電力中斷而停止運行之外，iSeq一直在全力運行，使用目標富集策略執行端對端新一代測序（NGS）反應，將鏈狀RNA-seq準備與隨后發生的游離狀態下的雜交富集反應結合起來。在測序過程中，Catherine Pratt對當地科學家進行了關于正確的測序技術和方案的培訓。這些工作產生了高質量的準確數據，讓科學及們可以確定導致EVD爆發的菌株的特性。

　　首例EVD于2018年5月在赤道省的Bikoro衛生區確診。截至7月份，Bikoro、Iboko和Wangata三個地區共出現54人感染，33人喪生。疫情在7月達到頂點后宣告結束，所有人都如釋重負，來自國外的急救人員開始收拾行李離開金沙薩。然而，在僅僅一周后的8月1日，在赤道省以東2000公里的北基伍地區爆發了第二次疫情。

　　INRB新建立的現場測序設施通過了能力測試，能夠迅速對新的爆發作出反應。Muyemebe博士和他的團隊得以在收到樣本后的4天內生成可利用的數據。數據表明，北基伍省的疫情爆發與赤道省最近的疫情爆發無關。

　　iSeq提供了及時、關鍵的信息——使病毒株的身份得以確認，這幫助科學家們確定了應對疫情的下一步措施。iSeq提供的高質量、高精度的測序數據，結合廣泛的流行病學發現，使當地科學家能夠分析疫情的傳播模式并追蹤疫情的起源。Illumina技術的加持在有效應對這一公共衛生危機的過程中發揮了重要的作用。

　　Wiley的目標是在非洲各地建立一個訓練有素的科學家網絡，以便能夠在當地迅速對公共衛生流行病作出反應。

　　Wiley表示：“新的現實是，不需要把樣本送到昂貴的基因組中心便能開展測序工作，可以進行測序的范圍已大大擴展。處理樣本的方案和試劑對用戶更加友好，測序儀更加輕便。這些優勢使得數據和結果可以更快地生成，也讓NGS成為應對疫情的另一個有效工具。”

　　Illumina的測序儀產品能夠解讀人類和病毒的基因組，改善人類的健康狀況。Illumina非常自豪可以通過測序儀來幫助整個非洲控制疫情。

　　*本文所載信息不一定反映政府的立場和政策，不應據此推斷為得到官方認可。