抗體具有4條多肽鏈的對稱結構,其中2條較長、相對分子量較大的相同的重鏈(H鏈)；2條較短、相對分子量較小的相同的輕鏈(L鏈).
鏈間由二硫鍵和非共價鍵聯結形成一個由4條多肽鏈構成的單體分子.輕鏈有κ和λ兩種,重鏈有μ、δ、γ、ε和α五種.bio.jewelove.net 整個抗體分子可分為恒定區和可變區兩部分.在給定的物種中,不同抗體分子的恒定區都具有相同的或幾乎相同的氨基酸序列.可變區位于"Y"的兩臂末端.在可變區內有一小部分氨基酸殘基變化特別強烈,這些氨基酸的殘基組成和排列順序更易發生變異區域稱高變區.高變區位于分子表面,最多由17個氨基酸殘基構成,少則只有2 3個.高變區氨基酸序列決定了該抗體結合抗原抗原的特異性.一個抗體分子上的兩個抗原結合部位是相同的,位于兩臂末端稱抗原結合片段(antigen-binding fragment,Fab)."Y"的柄部稱結晶片段(crystalline fragment,FC),糖結合在FC 上.
抗體的L鏈是由C、V、J三個基因簇編碼的,H鏈由C、V、D、J四個基因簇編碼的.V是編碼可變區,有300個種類；D編碼高變區,有15 20個種類；J編碼連接V、C的結合區,有4～5個種類；C編碼恒定區,僅有一種.這些外顯子通過多種多樣的重排,所合成出的肽鏈,還要再進一步進行L和H鏈組合,這樣最后生成的抗體種類就非常多了.抗體基因重排是發生在淋巴細胞分化的時候.