早年畢業于中國科技大學的何川教授現任芝加哥大學生物物理動態研究所主任,以及北京大學合成與功能生物分子中心主任。何川教授研究組主要從事化學生物學、核酸化學和生物學、遺傳學等方面的研究,近期在Nature Biotechnology,Molecular Cell雜志上發表新研究成果,解析基因組及轉錄組中新發現的突變,以及RNA甲基化表觀遺傳等方面的新發現。
核苷酸變異(Nucleotide variants),特別是那些與表觀遺傳功能有關的變體,并不僅僅是簡單的基因組序列變化,還為我們提供了關于調控的重要信息,而且這些變化也定義了高等生物中的細胞狀態,比如DNA中發現的5-甲基胞嘧啶(5-mC),就是真核生物表觀遺傳修飾中近期才解析的核苷酸變異。
但是研究表示,5-mC只是DNA表觀遺傳動態調控網絡的一個小成員,這一調控網絡還包括5-羥甲基胞嘧啶(5hmC),5-甲酰胞嘧啶(5- formylcytosine),5-羧基胞嘧啶(5-carboxylcytosine)。而且近期的研究證明了RNA具有可逆的N6- methyladenosine(甲基腺苷核苷酶)活性。
由此何川教授等人在Nature Biotechnology文章中,指出這些新發現將會打開表觀遺傳學研究領域的新局面,并且這些快速發展的研究進展也將極大的促進一些新技術的研發,特異性識別,富集和測序核苷酸修飾,比如此前的單堿基高分辨率測序方法TAB-Seq技術等。
另外一篇發表在Molecular Cell雜志上的文章中,何川教授與北京基因組研究所楊運桂研究組等合作,發現和鑒定了第二個m6A去甲基化酶-與FTO同屬加雙酶AlkB家族的ALKBH5,進一步證實了可逆m6A甲基化調控mRNA表達水平和RNA代謝過程。
6-甲基腺嘌呤(N6-methyl-adenosine(m6A))是高等生物中含量最為豐富的一種RNA甲基化形式,其甲基化由SAM類甲基化轉移酶催化而成。m6A是mRNA中存在的主要甲基化形式,可能參與mRNA剪接、運輸等加工過程,但mRNA中m6A的生物學功能并不清楚。
研究人員從生化、基因組學、細胞及模式生物多層次水平上,發現和鑒定了第二個m6A去甲基化酶-與FTO同屬加雙酶AlkB家族的ALKBH5,進一步證實了可逆m6A甲基化調控mRNA表達水平和RNA代謝過程;ALKBH5敲除小鼠生精小管細胞中mRNA的m6A甲基化水平升高,同時引起睪丸萎縮,精子數量減少,質量下降,生育率下降等病變,證實ALKBH5介導的RNA m6A去甲基化調控精子發育等重要生理功能。
這一研究工作為可逆RNA甲基化作為一種新的表觀遺傳調控機制提供了直接生物學證據,為代謝性疾病、生殖發育和惡性腫瘤的早期診斷與有效治療提供了新的思路和研究方向。
在國家自然科學基金項目(批準號:32125009、32430017)等資助下,西安交通大學葉凱團隊在基因組三維結構演化領域取得新進展。研究團隊創建了染色質長距離互作捕捉計算方法和跨物種分析手段,首次勾......
自21世紀初具有里程碑意義的人類基因組解碼工作完成以來,DNA測序技術迎來了爆發式發展。傳統計算機已難以滿足海量的數據與激增的算力需求,這推動人們尋求替代方案。如今,量子計算距離實用又近了一步。科學家......
南亞地區的人們以酸奶、印度奶酪和印度酥油等乳制品為食。現在,這一地區正幫助解開一個長期存在的謎題:人類是如何獲得消化牛奶的能力的。一項針對印度、巴基斯坦和孟加拉國現代及古代人類基因組的研究表明,一種能......
一項發表在最新一期《自然》雜志上的研究,通過對生活在10200至150年前的南非個體基因組進行分析,證實了在南部非洲,一群智人在半隔離的狀態下生活了數十萬年。這是迄今規模最大的對非洲古代DNA的研究,......
? 在美國人類遺傳學會(ASHG)年會上,因美納5堿基解決方案的早期試用客戶——倫敦健康科學中心研究所將展示該技術在加速罕見病病例解析方面的強大潛力。? 因美納專有的5堿基化學技術......
人類基因組中存在大量具有"跳躍"能力的逆轉座子(retrotransposon)序列。在胚胎發育早期、免疫和神經系統等特定階段和環境下,它們會被激活,發揮重要生理功能;在病毒感染、......
橡膠樹是天然橡膠的主要來源。“橡膠樹育種面臨的主要困難在于周期長和效率低,通過常規育種方法將多抗、高產性狀聚合往往需要30~40年。”中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員程漢告訴《中國科學報》。然而,目......
記者宋喜群、馮帆從山東農業大學獲悉,該校農學院教授孔令讓研究團隊首次組裝了小麥遠緣雜交常用物種中間偃麥草和鵝觀草染色體水平的高質量基因組序列,解析了二者基因組結構差異與獨立多倍化演化路徑,對兩者攜帶的......
胡贊民(右二)、范成明(左一)等正在查看油菜籽生長情況。遺傳發育所供圖5月的新疆和田,大地初披新綠。中國科學院遺傳與發育生物學研究所(以下簡稱遺傳發育所)高級工程師唐丁與博士生尤常清、博士后吳雪丹播完......
8月22日至23日,《知行嶺南?生命課堂進階計劃》——2025年廣東省生物學名師工作室聯合研修班在鼎湖山國家級自然保護區(以下簡稱鼎湖山保護區)分2批次開展科普課程學習。來自廣東省各地生物學名師工作室......