一、據報道，本藥不良反應發生率低于10%，其中因嚴重不良反應而需停止治療僅0.7%。
1.肌內注射或靜脈給藥時致注射部位疼痛較為多見，約占3.6%。
2.皮疹發生率較其它青霉素類藥高，約占1%～6%。偶有發生剝脫性皮炎、過敏性休克的報道。
3.少數患者用藥后可出現血清丙氨酸氨基轉移酶、天門冬氨酸氨基轉移酶一過性升高。
4.偶有腹瀉、惡心等胃腸道癥狀。
二、國外不良反應參考
1.血液系統 有報道少于1%的患者用藥后可出現鼻和粘膜出血、血液學實驗室檢查異常(血紅蛋白、血細胞比容、白細胞和血小板減少)。
2.中樞神經系統 有報道少于1%的患者用藥后可出現頭痛、抑郁等中樞神經系統癥狀。雖然沒有使用本藥導致癲癇發作的報道，但有研究表明氨芐西林和癲癇活躍有關系。
3.內分泌系統 動物研究已證明使用舒巴坦會導致肝細胞中的蛋白結合糖原減少。但在對糖尿病患者的對照研究中，沒有發現明顯的葡萄糖利用度改變。
4.消化系統 最常見的胃腸道癥狀是腹瀉，其它尚有惡心、嘔吐、胃腸脹氣等癥狀。偶有發生假膜性腸炎、味覺障礙的報道。
5.泌尿/生殖系統 有報道少于1%的患者用藥后可出現尿潴留、排尿困難、血尿素氮和血清肌酐增加。也偶有引起間質性腎炎的報道。
6.過敏反應 包括面部水腫、紅斑、皮疹、胸痛和喉部緊張感。
7.二重感染 有報道，長期用藥可出現菌群失調，發生二重感染。
8.其它 胃腸道外給藥速度太快或濃度過大可出現血栓性靜脈炎或注射部位疼痛。