隨著鹽酸氟西汀分散片的持續治療，不良反應的強度和發生頻率會減少，通常不會導致治療停止。
同其它SSRIs一樣，常見的不良反應如下：
全身：過敏（如搔癢、皮疹、風疹、過敏反應、脈管炎、血清反應、顏面水腫等）（見【禁忌】和【警告】)、寒戰、5-羥色胺綜合征、光敏反應及非常罕見的情況下，多形性紅斑有可能發展為斯-約二氏綜合征或中毒性表皮壞死松解癥（Lyell綜合征）。
消化系統：胃腸道功能紊亂（如腹瀉、惡心、嘔吐、消化不良、吞咽困難、味覺顛倒）、口干等。少見肝功能檢測異常，肝炎鮮有報告。
神經系統：頭痛、睡眠異常（如夢境反常、失眠、困倦）、頭暈、厭食、疲乏、欣快、短暫的動作異常（如抽搐、共濟失調、戰栗、肌陣攣等）、痙攣發作及罕見的精神運動性不安/靜坐不能（見【注意事項】）。5-羥色胺綜合征非常罕見。
精神科障礙：幻覺，躁狂反應，意識錯亂，激越，焦慮及有關癥狀（如緊張），注意力及思考能力減弱（如，人格解體），驚恐發作，五羥色胺綜合征極罕見，自殺觀念和行為（這些癥狀可以是由于潛在疾病造成的）。在氟西汀治療過程中或治療停止后早期報告有自殺觀念和自殺行為（見【注意事項】)。
泌尿系統：尿潴留，尿頻等。
生殖紊亂：性功能障礙（如延遲或缺少射精、性高潮缺乏）、陰莖異常勃起、溢乳。
其它癥狀：脫發、呵欠、視覺異常（如視力模糊，瞳孔散大等）、出汗、血管舒張、關節痛、肌痛、體位性低血壓和瘀癍。其它出血表現（如婦科出血、胃腸道出血和其他皮膚或粘膜出血）罕見報告（詳見【注意事項】：出血）。
一過性低血鈉：停服本品時極少數患者出現一過性低血鈉（包括血鈉低于110 mmol/L），且可逆。某些病例可能是由于抗利尿激素分泌失調引起。多數報道見于老年人、服用利尿藥的患者、或其它原因導致體液耗竭的患者。
呼吸系統：咽炎和呼吸困難。肺的不良事件罕見（包括組織病理學的炎性變化和/或纖維化）。呼吸困難可能是最初唯一的癥狀。