1.較為常見，可表現為藥疹，嚴重者可發生滲出性多形紅斑、剝脫性皮炎和大皰表皮松解萎縮性皮炎等。
2.血液系統反應：可發生粒細胞減少癥、血小板減少癥，偶可發生再生障礙性貧血；缺乏葡萄糖-6-磷酸脫氫-6-磷酸脫氫酶患者應用磺胺甲氧嗪后易發生溶血性貧血及血紅蛋白尿。
3.高膽紅素血癥和新生兒核黃疸。
4.肝功能損害：可出現黃疸、肝功能減退，嚴重者可發生急性肝壞死。
5.腎功能損害：可發生結晶尿、血尿和管型尿。
6.其他：可出現惡心、嘔吐、胃納減退、腹瀉、頭痛、乏力等，一般不影響繼續用藥。
