依那普利具有較好的耐受性。 在使用依那普利和ACEI藥物時，可能會出現以下不良反應。
心血管系統
在治療初期、患者有鹽和/或體液流失（如已使用了利尿劑）、心衰、嚴重高血壓或腎性高血壓及增加依那普利和/或利尿劑的用量時，會出現明顯的血壓下降（低血壓，直立性低血壓）并伴有頭昏眼花、蒼白、視覺混亂等。罕見意識喪失。
以下是由ACEI過度降低血壓引起的副反應：心跳過速、心悸、心率失常、胸痛、心絞痛、心肌梗塞、暫時性缺血性中風、大腦損害。
腎臟
偶爾可發生腎損害或者腎損害加重。在個別病例導致急性腎功能衰竭。觀察發現罕有蛋白尿，有時蛋白尿伴有腎功能惡化。
呼吸系統
偶爾發生干咳、咽痛、聲音嘶啞、支氣管炎。少見呼吸困難、鼻竇炎、鼻炎、支氣管痙攣/哮喘、肺浸潤、口腔炎、舌炎和口干。有ACEI可以引起喉部、咽部和/或舌部的血管神經性水腫的報道。
消化系統/肝
偶爾會發生惡心、腹痛和消化不良。少見嘔吐、腹瀉、便秘、食欲不振。在ACE抑制劑治療期間，曾有一個綜合性的罕見報道，開始時為膽汁淤積型黃疸，接著發展為肝壞死（有時會致命）。但是兩者關系不清。如果出現黃疸或肝酶顯著增加，應立即停止使用ACEI，并將患者置于醫療監控之下。 有報道，ACEI可以導致肝功異常、肝炎、肝功能衰竭、胰腺炎、腸梗阻。
皮膚，血管
偶爾會發生過敏性反應，如皮疹、蕁麻疹、瘙癢，累及唇、面和/或四肢的神經血管性水腫。 有引起嚴重皮膚反應的報道，如天皰瘡、多形紅斑、脫落性皮炎、Stevens-Johnson綜合癥或者中毒性表皮壞死溶解。 皮膚病變可能伴隨發燒、肌痛/肌炎、關節痛/關節炎、脈管炎、漿膜炎、嗜酸性粒細胞增生、白細胞增多、ESR和/或ANA增加。如果懷疑是嚴重的皮膚反應，立即同主治醫生聯系，如果必要，必須中止馬來酸依那普利片的治療。 有報道，ACEI會導致銀屑樣皮膚改變，光敏，臉紅，出汗，脫發，甲癬以及Raynaud綜合征加重。
神經系統
偶爾會發生頭痛、嗜睡。 罕見昏迷、抑郁、睡眠障礙、陽痿、外周感覺異常、平衡失調、肌肉痙攣、神經過敏、混亂、耳鳴、視覺模糊、偏側味覺缺失。
實驗室檢測（血、尿）
偶發血紅蛋白、血球容積、白細胞、血小板減少。罕見貧血、血小板減少、中性粒細胞減少、嗜酸性粒細胞增加。在有腎功能障礙、膠原蛋白疾病以及同時服用別嘌呤醇、普魯卡因胺或其他免疫抑制劑的患者中，會發生粒細胞缺乏和凡科尼綜合征。 有患者發生溶血/溶血性貧血，以及同G-6-PDH缺乏相關的溶血/溶血性貧血。但是與ACEI的因果關系沒有建立。 腎功能障礙患者偶爾會出現血尿濃度，血肌酸和血鉀濃度增加，血鈉濃度減少。糖尿病患者會出現血鉀濃度增加（高血鉀）。可檢出尿蛋白排出量增加。偶爾可能出現膽紅素和肝酶濃度的增加。
注意
如上這些實驗室檢查應在服用依那普利前和期間常規檢驗。 對于初始用藥、高風險（腎衰，膠原病）患者和使用免疫抑制劑，細胞抑制劑，別嘌呤醇及普魯卡因胺的患者應該檢查血漿電解質、肌酐酸濃度和血象。服用依那普利期間出現發燒、淋巴結紅腫和/或咽喉炎，應立即檢查白細胞計數。
對駕駛和操縱機械能力/反應的影響：
開始治療時、增加劑量、換藥及同時飲酒時，發生反應的次數和程度因個體情況而不同，此時須嚴格限制開車和操縱機器。