使用miRNA的芯片及定量PCR數據研究超急性期腦梗死（HACI）的新穎標志物循環血miR-16
研究背景
全世界范圍內，卒中嚴重降低其患病者的生存質量。而缺血性卒中占整個卒中的70-85%。快速診斷對超急性期腦梗死的臨床決策非常重要。人們逐漸把尋找生物標志物的方向投向循環血的miRNA。但腦梗死病因復雜，分類繁多，使尋找特異性和敏感性高的循環血miRNA標志物困難重重。本研究使用miRNA的芯片及定量PCR數據來判定miRNA對超急性期腦梗死（HACI）的診斷價值，以TOAST及OCSP分型來探討血漿的miRNA與腦梗死分型的關系，以MRS評分來摸索血漿的miRNA與腦梗死預后的關系。
研究思路
研究結果
1、 HACI與健康對照組（HVT）之間的芯片差異譜
以改變倍數大于2，p小于0.05的miRNA作為差異基因。11個miRNA是上調的 (miR-140,miR-106b,miR-130a,miR-16,miR-223,miR-93,miR-484,miR-25,miR-130b ,miR-107,andmiR-151)，一個miRNA是下調的(miR-4454)。在芯片的聚類熱圖中本研究選送的4個對照標本自動聚攏為一個組，說明選送標本代表性良好。該研究中Agilent Human miRNA (8_60K) V19.0 array服務由伯豪生物提供。
2、以定量PCR驗證芯片差異表達譜
研究者從芯片差異表達譜的12個miRNA中挑選標準化信號值較高的7個進行定量PCR驗證。7個miRNA在定量PCR中的變化趨勢有6個與芯片變化趨勢相同，一個與芯片相反，說明二者較好的一致性。比較7個miRNA的定量PCR結果僅miR-16有統計差異。
3、基于miR-16的預測靶基因進行生物信息學分析
差異最顯著的GO類別（生物學進程）主要包括細胞分化，細胞死亡，發育過程，凋亡，細胞增殖，細胞周期等。KEGG類別包含的主要經典信號通路有：p53，T細胞受體，ErbB，Toll-樣受體(TLR)，NOD-樣受體，MAPK。
