真菌培養對營養要求不高,需較高的濕度和氧,常用沙保培養基,但生長速度緩慢,一般需要1~4周才能形成菌落；菌落有三種類型：
①酵母型菌落：較細菌菌落大而厚,外觀潤濕和致密,多為乳白色,少數是粉色。因多數單細胞真菌的菌落是酵母型菌落,所以鏡下檢查見圓形或卵圓形單細胞。
②類酵母型菌落：單細胞真菌以出芽方式繁殖,白假絲酵母菌等少數菌種的芽管延長且不與母細胞脫離而形成假菌絲,假菌絲可伸入培養基。
③絲狀菌落：多細胞真菌都形成絲狀菌落,較細菌和放線菌的菌落大而質地疏松,呈絨毛狀、氈狀、棉絮狀,因菌絲深入生長故菌落與培養基緊密相連,不易被挑起。鏡檢見菌絲體,部分菌絲有孢子生長。菌落形態、顏色、結構是真菌菌種鑒定的參考。
真菌菌絲和孢子對熱的抵抗力都不強,60℃~70℃加熱一小時均可被殺死,而對干燥、陽光、紫外線和一些消毒劑都有抵抗力；但對2.5%碘酒和10%甲醛較敏感。了解真菌結構有助于闡明其致病機制,并為真菌病臨床診斷、治療和預防提供信息或依據。