動物的骨和齒的磨片在普通顯微鏡下并不能看得仔細,可是在偏光鏡檢查下,則有強烈的顏色和條紋對比。偏光也可將正常的細胞和腫瘤細胞分辨開來,因為正常細胞對偏光常常是呈左旋性的,而腫瘤細胞則多呈右旋性；有些動物的橫紋肌和毛發也可以用偏光鏡來檢查。因此,許多動物藥材如豹骨、象牙、海龍、海馬、龜板、鱉甲、蛇類等,甚至包括許多動物角類、結石、分泌物藥材,如鹿角、羚羊角、牛黃、馬寶、猴棗、珍珠、麝香、燕窩等均可考慮用（如傳統膏方）
偏光顯微鏡來進行檢查。已有報道,可通過偏光顯微鏡觀察,測算出麝香藥材中摻偽物質的含量。