首先明確代謝組學的核心任務。對小分子代謝物的定性、定量分析并發現差異代謝物:(1)對生物體系中的內源性代謝物及其變化規律進行表征;(2)以差異代謝物作為核心對生命奧秘進行解析。而基于色譜/質譜聯用的分離分析技術具有靈敏度高、選擇性好、動態范圍寬、信息豐富等優點,已成為代謝組學研究的主流技術平臺。
其次明確代謝組學的研究方法。對于非靶向代謝組學而言,色譜與高分辨質譜的聯用必不可少;而對于靶向代謝組學而言,基于多反應監測(MRM)模式的三重四極桿質譜被認為是質譜定量的 “金標準”。近年來,擬靶向技術由于結合了非靶向和靶向分析技術的雙重優勢,在代謝物分析的覆蓋度上與非靶向方法接近,在靈敏度上與靶向分析一樣,迅速發展成為代謝組學的主流研究方法。擬靶向代謝組學主要包括三個步驟:(1)基于四極桿飛行時間質譜的非靶向分析;(2)母離子/產物離子對的選擇及檢測參數優化;(3)使用三重四極桿或QTRAP質譜采用MRM模式(包括上述離子對)對樣品進行分析。
關鍵點有哪些?代謝組學整個研究過程可以細分為20多個步驟,若每一步準確率為70%,最終結果的準確率不足0.1%,因此必須確保每一步(尤其是關鍵步驟)都規范、準確,才能保證研究結果準確、可靠。影響代謝組學研究質量的關鍵環節包括:(1)系統科學的研究方案;(2)樣本收集、分組、儲存、前處理、質量控制;(3)數據采集與質量控制;(4)數據處理、分析;(5)差異分子篩選與鑒定;(6)分類模型構建與驗證;(7)數據庫自建、管理與使用。這些環節受制因素較多,需要參考研究論文、技術規范、注意過程控制,采用專業的技術和工具支持才能獲得高質量的研究結果。
為什么關鍵?圍繞快速、有效地發現分子和標志物這一目的,精準和高通量正成為引領發展的方向。代謝組學研究需要滿足生物醫藥、食品等行業的個性化分子智能識別需求,所以需要分子智能識別檢測技術做支撐,需要自主知識產權的核心算法,才能保證專業化的組學、質譜數據處理、數據挖掘。
總結來說,在組學研究過程中,只有做好分子特征檢測、差異分子篩選、差異分子鑒定、分類模型構建、數據庫自建等關鍵步驟,才能得到最好的組學研究結果。
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