（1）囊腫穿刺抽液術：在b 型超聲引導下經皮囊腫穿刺，抽盡囊液。此法操作簡單，可重復穿刺或穿刺后置管。穿刺前須排除肝包蟲囊腫后方可實施。應嚴格無菌技術，避免囊內出血及膿腫形成。
（2）囊腫摘除術：容易剝離的單發性囊腫可采用此種手術，治療較徹底。
（3）囊腫“開窗”術：用于囊腫位于肝的淺層且無感染或膽管與囊腫無交通的情況。切除部分囊腫頂壁（即“開窗”），吸凈囊液，使囊腔向腹腔內開放。若囊腫并發感染或囊內有陳舊性出血時，開窗后清理囊腔，并將部分帶蒂大網膜填塞囊腔，腹腔內置“煙卷”、血漿管引流。若囊液染有膽汁時，清理囊腔，確定無繼續溢漏膽汁后，按上述方法行大網膜填塞囊腔。
（4）囊腫內引流術：用于囊腔內有溢漏膽汁又不易找出膽管開口，或囊壁較堅厚及感染嚴重的囊腫。
（5）非典型肝部分切除并用囊腫“開窗”術：彌漫性肝囊腫某一葉囊腫密集、壓迫致使該葉肝實質明顯萎縮，可行非典型肝部分切除術，而其余肝囊腫并用“開窗”術。
（6）囊腫外引流術：囊腫感染而又不易耐受其他較復雜手術時，可行暫時性外引流術，但易形成長期不愈的外瘺，往往需二期手術。