(一)腎或者其他器官移植及腎臟疾病
1.器官移植：移植前使用免疫吸附治療處于高敏免疫狀態的患者，可迅速清除HLA抗體，使交叉配型轉陰，減少了急性排斥反應的發生率。移植后，當移植物出現機能惡化，活檢發現發生急性排斥反應時，使用強化免疫吸附并聯用抗排斥藥物，可使排斥反應逆轉。
2.新月體型腎炎：免疫吸附可有效治療肺出血一腎炎綜合征、Wegener肉芽腫、結節性多動脈炎、狼瘡性腎炎等疾病，通過清除自身抗體和免疫復合物，患者的臨床癥狀、腎臟功能均有明顯改善。
3.脂蛋白腎病：通過體外循環，用免疫吸附柱清除血漿中存在的異常脂蛋白，可使腎功能恢復正常。
4.IgA腎病：采用分離純化的腎炎致病物質IgA對動物進行免疫，從抗血清中分離純化特異性多克隆抗體，經固定化后制備IgA腎病免疫吸附劑。特異地清除患者血液中的致病物質IgA和免疫復合物，達到治療目的。
(二)血液病
1.免疫性溶血性貧血疾病診斷一旦明確，應立即進行治療，清除血液中的抗紅細胞抗體。
2.血友病免疫吸附可清除抗凝血因子VIII或Ix的抗體，控制急性出血。
3.血小板減少性紫癜用于治療傳統藥物或手術方法難以奏效的血小板減少性紫癜，清除抗血小板抗體。
4.伴有免疫復合物的過敏性紫癜免疫吸附可除去血中部分免疫復合物，緩解癥狀。
(三)神經系統疾病
1.重癥肌無力免疫吸附能有效清除患者血清中的抗乙酰膽堿受體抗體補體及免疫復合物等，快速改善患者的臨床癥狀，特別是有嚴重的呼吸肌麻痹和吞咽障礙的重癥患者。現在用免疫吸附治療重癥肌無力已積累了許多經驗，通過用色氨酸、蛋白A或合成乙酰膽堿受體的方法可提高其作用的特異性。
2.格林一巴利綜合征格林-巴利綜合征患者存在抗周圍神經組織的自身抗體，通過免疫吸附清除抗體，可使病情迅速恢復。
(四)風濕性疾病
系統性紅斑狼瘡、類風濕關節炎、皮肌炎、結節性多動脈炎等，尤其是激素治療無效的患者。