IgA具有抗菌、抗毒、抗病毒作用，對支原體和某些真菌可能也有作用。
血清型免疫球蛋白A的作用
血清IgA具有多種抗體活性，如同種血凝素，抗胰島素，抗布氏菌，抗白喉毒素，抗脊髓灰質炎病毒抗體等。有人認為IgA與組織抗原或蛋白抗原具有特殊結合力，從而可消除進入循環中的此類抗原，防止這些抗原誘導的炎癥或自身免疫。已發現，若IgA缺乏，可伴有體內抗甲狀腺球蛋白、腎上腺組織、DNA等的自身抗體水平升高。
分泌型免疫球蛋白A的作用
SIgA對機體局部免疫，如保護呼吸道、消化道粘膜有重要作用。SIgA合成功能低下的幼兒易患呼吸道或消化道感染；老年性支氣管炎也可能與呼吸道SIgA合成功能降低有關。由于外分泌液中SIgA含量多，又不易被一般蛋白酶破壞，故成為抗感染、抗過敏的一道重要的免疫“屏障”。