由于電源和儀器的放大倍數會產生漂移，從而使閃爍計數器的工作點產生漂移，因此，閃爍計數器應工作在坪區，使計數比較穩定。閃爍計數器的坪長，除與閃爍體有關外，還與光電倍增管的總靈敏度、噪聲、高壓不穩定和儀器的放大倍數等因數有關。
所以測量時必須合理選擇這些參數，使計數器有較長的工作頻段，計數效率比較穩定。而GC-1200雙探頭丫免疫計數器采用計算機控制，所有的參數的送人和改變均采用鍵盤操作完成。該機有較完善的測量功能，可完成自動計數測量、本底測量、效率測量、丫能譜自動測量、丫頻譜自動測量、雙探測器自動校正，給使用和維修帶來極大的方便。
由于兩個光電倍增管的不一致性所引起的誤差，當同一份標本分別在兩個探頭里所測量的計數量不同，且相互偏差大于5時，將造成測量標本的結果誤差和重復性不好。由于在雙探頭使用時會有一定的誤差，故在平時需要做質量控制。
例如：當GC-1200雙探頭丫免疫計數器出現上述誤差時，可使用隨機攜帶的質量控制軟件做探測器的校正，同時應檢查探頭內是否有污染，無法解決時再考慮是否機器硬件故障。拆開機器拔插機內電路板時一定要關掉主機電源，避免由于電流的沖擊而使集成電路元件受到損壞。
任何故障開始檢修時應首先檢查各組電源是否正常(包括保險絲、電纜線以及輸入電壓等。置放儀器的環境應干燥、清潔。
樣品傳動故障，應先檢查傳動平臺上的各個微動開關是否接觸良好。機械上的故障易造成樣品管子破裂，引起本底升高，這時可用肥皂水徹底清洗升桿頭等有關位置，但高壓電流偏離也會引起本底升高，具體情況作具體分析，再做有關判斷與排除。總之，不要輕易打開探測器檢修。檢修探測器時要注意避光防潮以免損壞晶體。由于該機有兩套分別獨立的電路所以在維修過程中可以使用交換法、替代法來縮小維修范圍。