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  • 發布時間:2020-04-03 20:53 原文鏈接: 全景組織細胞定量分析系統技術在新冠肺炎相關研究1

    2月17日,上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院新冠肺炎病因診斷專家組踏上征程。該專家組由國家衛健委委派,赴武漢開展新冠肺炎病理學和病因診斷研究工作。他們的主要任務是進行新冠肺炎病例的病因分析,深入研究疾病發生發展的病理生理過程,并為后續研究提供重要科學支撐。與此同時,全國首批新冠肺炎逝者遺體解剖也已在武漢金銀潭醫院完成。

    為什么病理學信息至關重要?

    目前,臨床上對于新冠肺炎的了解和認知大都來源于臨床癥狀、影像學、檢驗分析、病毒分析等方面研究。但要真正直觀地了解器官的損傷、如何損傷、體內器官損傷如何相互關聯影響等問題,都需要通過病理學信息來解決。

    病理學家指出,「對于新冠肺炎而言,通過病理解剖研究疾病發生機理,有助于幫助臨床糾正可能的錯誤診療方案。此外,超微結構、分子病理等方面研究也可以幫助其他領域的專家做很多事情。」

    COVID-19患者的病理學特征


    SARS-CoV-2感染患者的雙肺、肝臟及心臟組織病理標本(Zhe Xu, Lei Shi, Yinjin Wang.etal. Pathological findings of COVID-19 associated with acuterespiratory distresssyndrome. Lancet Respir Med 2020

    根據解剖完成的肺組織切片鏡下可見,COVID-19的患者存在彌漫性的肺泡損傷,伴有支氣管上皮剝脫、纖毛脫落、鱗狀上皮化生等病變;以及肺泡壁大量的炎性滲出,導致患者呼吸困難、血氧含量降低。死者大部分肺泡和肺間質巨噬細胞浸潤、肺泡上皮細胞增生,形成雙嗜性胞漿豐富的多核巨細胞。

    病理學信息是重大疾病確診的最終診斷標準,組織圖像中細胞不是獨立存在的,而是交織、混雜在一起,同種細胞形態上有時也會存在較大差異,要想做到組織圖像中每個單細胞標記marker的準確量化、準確的單細胞識別是后續量化的基礎。TissueFAXS CytometryZL的單細胞識別技術,可以做到組織內不同大小、染色強度、形態等差異性非常大的細胞核、質、膜多組分準確識別,保證細胞統計準確性,為后續量化分析奠定了堅實基礎。

    TG & COVID-19

    奧地利TissueGnostics公司的TissueFAXS CytometryZL技術是一種基于全景組織細胞定量分析系統的圖像處理的病理定量分析技術,能夠實現包括超大尺寸病理切片全景掃描和細胞培養樣本的數字化全息獲取;從亞細胞到組織水平的大數據定量分析;目標細胞/組織/結構空間分布水平數字化定量以及完成從體視學到大數據的雙向獨立、可重復的驗證。



     

    針對新冠肺炎的研究,TissueFAXS Cytometry技術具有極大的應用意義。
     

    1. HE/IHC樣本組織:自動對簡單HE染色下肺組織中所有細胞輪廓進行識別,結合自動肺泡/支氣管的組織識別功能,迅速判斷炎性細胞數量、浸潤程度、上皮脫落面積、纖維化程度等指標。

    2. IF樣本組織:結合標記特異性蛋白Marker的免疫組化或免疫熒光技術,可以更進一步研究肺組織微環境中浸潤的免疫細胞表型、上皮細胞化生程度等實驗室精準定量指標。

    3. 病毒原位研究:利用特異性核酸熒光探針以及免疫熒光技術,共同標記病毒相關蛋白的表面抗原及核酸核心,不但可以從圖像中精準定量病毒在細胞內外的數量及位置 — 建立通中過肉眼可以判斷的病毒載量定量標準,同時分析病毒的增殖侵襲過程和組織的相互空間關系!



    TissueFAXS Cytometry技術相關案例1

    無標記形態學識別及定量分析肺組織中的支氣管/血管/肺泡
     

     

    肺組織原始影像

     

    支氣管識別

    肺血管識別

    肺泡識別

    肺泡二維散點圖定量分析


    通過顏色及形態學參數,在識別肺泡細胞/支氣管上皮細胞/血管內皮細胞/紅細胞的基礎上,對無特殊染色標記的肺組織中支氣管、血管、肺泡的數量/大小/形態進行定量分析。

    TissueFAXS Cytometry技術相關案例2

    HE染色下自動識別并定量肺腫瘤/血管/炎性滲出區域/正常肺泡區域



    原始影像

    肺部腫瘤(紅)、血管(粉)、炎性滲出區域(綠)、正常肺泡區域(黃)的識別
     



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