全自動氨基酸分析儀的測定原理是利用樣品各種氨基酸組分的結構不同、酸堿性、極性及分子大小不同，在陽離子交換柱上將它們分離，采用不同pH值離子濃度的緩沖液將各氨基酸組分依次洗脫下來，再逐個以另一流路的茚三酮試劑混合，然后共同流至螺旋反應管中，于一定溫度下（通常為115～120℃）進行顯色反應，形成在570nm有最大吸收的藍紫色產物。
其中的羥脯氨酸與茚三酮反應生成黃色產物，其最大吸收在440nm。
