結果計算
帶有數據處理機的儀器，各種氨基酸的定量結果能自動打印出來，否則，可用尺子測量峰高或用峰高乘以半峰寬確定峰面積進而計算出氨基酸的精確含量。另外，根據峰出現的時間可以確定氨基酸的種類。
說明
① 顯色反應用的茚三酮試劑，隨著時間推移發色率會降低，故在較長時間測樣過程中應隨時采用已知濃度的氨基酸標準溶液上柱測定以檢驗其變化情況。
② 近年出現的采用反相色譜原理制造的氨基酸分析儀，可使蛋白質水解出的17 種氨基酸在12min 內完成分離，且具有靈敏度高（最小檢出量可達1pmol）、重現性好以及一機多用等優點。