(3)試劑瓶(BOTTLE)。有不同的形狀及大小規格。如 COBAS MIRA PLUS儀有4、10、15、35ML等規格，瓶底呈凹形，OLYMPUS AU600儀有30和60ML兩種；日立7060儀有20、50、100ML三種等規格。應根據工作量和試劑規格．考慮試劑瓶殘留死體積和更換頻率，合理選用。獨特設計的卡式試劑盒，體積小，防蒸發，方便儲存。
(4)配套試劑常有條形碼，儀器設有條形碼檢查系統，可對試劑的種類、批號、存量、有效期和校準曲線等貨剌，進行核對校驗，如BECKMANCX7等。
(5)試劑瓶蓋自動開關系統，更有利于試劑保存。有的儀器可在運行中添加，更換試劑，有的則須在暫停狀態進行。
3．條形碼(BARCODE)識讀系統
一般由掃描系統、信號整形和譯碼器三部分組成。掃描系統以光源掃射黑條白空相間的條碼符號由于條和空對光的反射不同、不同寬窄的條符反射光持續時間不同，產生強度不同的反射光．再經光電轉換元件接收并轉換成相應強度的電信號，最后通過信號整形，由譯碼器解譯。系統自動識別樣品架及樣品編號識別試劑、校準品及其批號、失效期，有的并可識別校驗校準曲線等信息。
實驗室常用條形碼類型有CODE 39、CODE 128、2 OF 5 STANDARD、INTERLEAVED2OF 5等。要自編樣品條形碼需要條形碼輸入器，條形碼閱讀系統與條形碼要匹配。已有全自動試管分配暨條形碼粘貼準備系統。
4．反應系統
(1)反應盤裝載一系列反應比色杯（CUVETTES）,多為轉盤形式。反應測定過程中按固定程序，在加樣臂、加液臂、攪拌棒、光路和清洗裝置之間轉動。有的儀器在反應杯中完成反應后再吸入比色杯比色，現在更常見反應和檢測同在比色杯中進行，效率更高，尤其適于連續監測法。比色杯多采用硬質石英玻璃、硬質玻璃、無紫外光吸收的丙烯酸塑料等，使用壽命不一。DIMENSION系列的比色杯在機器內自動制造，自動封口，免沖洗，無污染。流動池式主要在小型分析儀用。容積一般幾十微升，但抽液管道占用較多反應液，多樣品連續使用，增加交叉污染機會。
蠕動泵(PUMP)。半自動生化儀需要蠕動泵抽吸反應液進人流動比色池作測定。要求定期對蠕動泵校準，即通過吸人定量的水來檢驗泵的吸液量是否準確。一般均設有泵校準功能。
(2)混合裝置(MIXING UNIT) 如采用多頭回旋攪拌棒(二頭雙清洗式攪拌系統)。攪拌棒常具特氟隆不粘涂層，避免液體粘附。
(3)溫控裝置生化分析儀通過恒溫控制裝置來保持孵育溫度的調控和恒定也是由計算機來控制的，理想的孵育溫度波動應小于±01℃。保持恒溫的方式有三種。①空氣浴恒溫：即在比色杯與加熱器之間隔有空氣。空氣浴恒溫的特點是方便、速度快、不需要特殊材料，但穩定性和均勻性較水浴稍差。羅氏(ROCHE)的COBAS和0LYMPUS AU2700系統采用的就是空氣浴恒溫模式。②水浴循環式：即在比色杯周圍充盈有水，加熱器控制水的溫度。水浴恒熱的特點是溫度恒定，但需特殊的防腐劑以保證水質的潔凈，且要定期更換循環水。日立系統生化分析儀采用的即是水浴循環恒溫裝置。⑧恒溫液循環間接加熱式：結構原理是在比色杯周圍流動著一種特殊的恒溫液(具無味、無污染、惰性、不蒸發等特點)。比色杯和恒溫液之間有極小的空氣狹縫，恒溫液通過加熱狹縫的空氣達到恒溫，其溫度穩定性優于干式，和水浴式循環式相比不需要特殊保養。
5．清洗(WASH)系統
探針和攪拌棒采用激流式等方式自動沖洗。清洗裝置一般由吸液針、吐液針和擦拭刷組成。清洗工作流程為吸出反應一吸于一注入純水一吸干一擦干。清洗液有堿性和酸眭兩種。一般說來，在吸出反應液后，儀器先用堿性液沖洗，再用酸性液沖洗，最后用去離子水沖洗三遍。擦拭刷的功能是吸去杯壁上掛淋的水，刷體內部有負吸裝置。使用進程中要注意擦拭刷是否磨損。
值得注意的是，對于常規沖洗還不能清除交叉污染(CARRY—OVER)的實驗要特別處理，以減少交叉污染或攜帶污染。例如，膽固醇測定試劑中的膽酸鹽對血清總膽汁酸的測定有干擾，在消除交叉污染的程序中，可輸入程序，指令總膽汁酸不在測試膽固醇的比色杯中進行測定，如不能避開，儀器則對比色杯進行特別沖洗，防止發生交叉污染。