蘭州大學、中科院Cell子刊發表微生物組研究新成果

　　來自中科院昆明動物研究所、中科院北京生命科學研究院和蘭州大學的研究人員，在新研究中揭示出了高海拔哺乳動物瘤胃微生物組的趨同進化。研究結果發布在6月16日的《Current Biology》雜志上。

　　中科院昆明動物研究所的施鵬（Peng Shi）研究員、中科院北京生命科學研究院趙方慶（Fangqing Zhao）研究員和蘭州大學的龍瑞軍（Ruijun Long）教授教授是這篇論文的共同通訊作者。

　　研究遺傳適應是進化生物學的一個中心焦點，一直以來大多數的這類研究通常都將焦點放在宿主的基因組上，而很少涉及共同進化的微生物組。青藏高原（QTP）為人類和其他哺乳動物物種提供了一個最極端的生存環境。牦牛（Yaks）和藏系綿羊已適應了在這一嚴酷的高原環境中生活，游牧藏民飼養這些動物以獲取食物及維持生計。

　　在這篇文章中，研究人員揭示出了在兩種高原反芻動物牦牛和藏系綿羊中為持續地獲得能量瘤胃微生物組發生的趨同進化。相比于低海拔的近親家牛（cattle）和普通綿羊，兩種反芻動物生成了顯著低水平的甲烷及高水平的揮發性脂肪酸(VFAs)。超深度宏基因組測序揭示出在高海拔反芻動物中富含生成VFA的瘤胃微生物基因信號通路，而在家牛宏基因組中富含甲烷生成信號通路。分析RNA轉錄組揭示，在高海拔反芻動物瘤胃上皮中與VFA運輸和吸收相關的36個基因顯著上調。這些研究結果重新認識了微生物組對哺乳動物適應性進化的貢獻。

　　牦牛是我國西部高寒高海拔地區 特有的家畜,主要分布在我國青藏高原海拔3000米以上的地區。牦牛經過長時間的自然選擇,能夠適應高海拔地區寒冷和低氧的自然環境,是研究極端環境適應性的模式物種之一。2012年來自蘭州大學，深圳華大基因研究院，昆明動物研究所以及美韓等處的研究人員完成了已馴化牦牛基因組的測序圖譜工作，并進行了初步分析，從中揭示了關于高海拔動物的相關遺傳適應性。研究成果發布在Nature Genetics雜志上。

　　RNA-Seq 作為近年來新發展起來的高通量轉錄組測序技術, 為大規模轉錄組學研究提供了一種全新的且更為有效的方法，2014年來自西南民族大學，深圳華大基因的研究人員以牦牛卵巢組織作為研究對象, 應用RNA-Seq技術對其進行高通量轉錄組測序分析,獲得了卵巢測序文庫，并進行了深入分析。這為描繪牦牛卵巢正常轉錄組圖譜及進一步探析牦牛繁殖性能提供了基礎。

　　2015年，來自蘭州大學、四川大學的研究人員通過對牦牛進行全基因組重測序揭示出了一些馴化標簽和史前的種群擴張。這項研究發布在Nature Communications雜志上。