分子軌道理論是比價鍵理論更精確的方法，其理論要點有
1、分子中的電子不屬于某個原子軌道，而屬于整個分子；
2、分子軌道由原子軌道線性組合而成，分子軌道數目等于組成分子軌道的原子軌道數目，其中些軌道能量降低，成為“成鍵軌道”另一些能量升高，成為“反鍵軌道”，還有一些能量不變，稱“非鍵軌道”；
3、原子軌道在線性組合時，遵守“對稱性匹配原則”、“能量相近原則”、“最大重疊原則”；
4、電子在分子軌道中排布時，遵守“能量最低原理”、“泡利不相容原理”、“洪特規則”；
分子軌道理論能解釋一些價鍵理論無法解釋的現象，比如氧分子的順磁性。
氧原子的外層電子數為6，這六個電子中的四個組成兩對，其它兩個單獨存在。
這兩個單獨的電子與另一個原子中相應的單獨的電子結合組成兩個新的共用的電子對，由此達到電子飽和的狀態。
需要說明的是這里所描述的氧分子的模型是一個簡化了的模型，實際上的氧分子要比這里描述的要復雜得多，因為這6個外層原子分布在不同的軌道上，因此它們不能形成這樣簡單的電子對。實際上的氧分子有三對共用的電子對和兩個單獨的電子。