致病條件與全國各地破傷風梭菌相似。產氣莢膜梭菌既能產生強烈的外毒素，又有多種侵襲性酶，并有莢膜，構成其強大的侵襲力，引起感染致病。毒素的毒性雖不如肉毒毒素和破傷風毒素強，但種類多，外毒素有α、β、γ、δ、ε、η、θ、ι、κ、λ、μ、ν等12種，和具有毒性作用的多種酶，如卵磷脂酶、纖維蛋白酶、透明質酸酶、膠原酶和dna酶等，構成強大的侵襲力。根據細菌產生外毒素的種類差別，可將產氣莢膜梭菌分成a、b、c、d、e5個型。對人致病的主要是a型，引起氣性壞疽和食物中毒。c型則引起壞死性腸炎。在各種毒素和酶中，以α毒素最為重要，α毒素是一種卵磷脂酶，能分解卵磷脂，人和動物的細胞膜是磷脂和蛋白質的復合物，可被卵磷脂酶所破壞，故α毒素能損傷多種細胞的細胞膜，引起溶血、組織壞死，血管內皮細胞損傷，使血管通透性增高，造成水腫。此外，θ毒素有溶血和破壞白血球的作用，膠原酶能分解肌肉和皮下的膠原組織，使組織崩解，透明質酸酶能分解細胞間質透明質酸，有利于病變擴散。本菌能引起人類多種疾病，其中最重要的是氣性壞疽。