伏格特-小柳-原田綜合征的病因尚不完全清楚,主要與自身免疫反應及感染因素有關。虹膜睫狀體的病理改變在本質上與脈絡膜改變相同,系由上皮樣細胞、淋巴細胞和漿細胞等構成的病灶,有時可見有淋巴細胞的有絲分裂征象,但在虹膜內上皮樣細胞形成不及脈絡膜內明顯。