內含肽intein是位于宿主蛋白質中的一段插入序列，前綴in一取自inventing, 后綴tein一取自protein。與內含肽相對應的另一專用術語是外顯肽。內含肽基因不是一個獨立的基因， 必須插入于外顯肽基因才能復制轉錄，可從前體蛋白中切除并將兩側外顯肽連接起來成為成熟蛋白質。其對應的核苷酸序列嵌合在宿主蛋白對應的核酸序列之中，與宿主蛋白基因存在于同一開放閱讀框架(open reading frame，ORF)內，并與宿主蛋白質基因進行同步轉錄和翻譯，當翻譯形成蛋白質前體后，內含肽從宿主蛋白質中切除，從而形成成熟的具有活性的蛋白質。