1、由于前S1抗原出現在急性乙肝感染的最早期，在轉氨酶升高前即可查出，所以它可作為早期診斷乙肝病毒感染的指標。
2、急性乙肝患者前S1抗原陰轉越早，預后越好，是病毒清除的最早跡象。反之，前S1抗原持續陽性，預示著感染將發展成慢性乙肝。
3、抗HBe(+)慢性乙肝約占慢肝的30-50%，檢測前S1抗原陽性，提示病毒在機體內繼續復制，此類患者更容易演變為肝硬化或肝癌。加查前S1抗原彌補了HBeAg的缺失造成的診斷和治療困難。
4、在HBV(嗜肝DNA病毒)無癥狀攜帶者中，有一定比例的抗HBe(+)者，加查前S1抗原可反映病毒在體內還較活躍，提示病毒并沒有清除，肝臟還有潛在的病理損傷的可能。
5、抗病毒治療乙肝，加查前S1抗原可作為治療前的患者篩查(適應癥)和治療后的療效判斷，尤其對抗HBe(+)的慢性乙肝患者抗病毒藥物治療的排查可起到重要作用。(國外已有文獻報道，前C區變異者不適宜用干擾素。)