引起本癥原因很多，以腸系膜上動脈壓迫十二指腸形成壅積者居多（占50%），該情況也稱為腸系膜上動脈綜合征（superior mesenteric artery syndrome）。其他原因有
①先天異常：如先天性腹膜束帶壓迫牽拉而阻斷十二指腸；十二指腸遠端先天性狹窄或閉塞，環狀胰腺壓迫十二指腸降段；十二指腸發育不良產生的巨十二指腸，以及十二指腸因先天性變異而嚴重下垂，可摺拗十二指腸空腸角而使之關閉，從而產生壅積癥。
②腫瘤：十二指腸良、惡性腫瘤；腹膜后腫瘤如腎臟腫瘤、胰腺癌、淋巴瘤；十二指腸的轉移癌，鄰近腫大的淋巴結（癌轉移）、腸系膜囊腫或腹主動脈瘤壓迫十二指腸。
③十二指腸遠端或近端空腸浸潤性疾病和炎癥；如進行性系統性硬化癥、Crohn病以及憩室炎性粘連或壓迫引起縮窄等。
④膽囊和胃手術后發生粘連牽拉十二指腸；胃空腸吻合術后粘連、潰瘍、狹窄或輸入袢綜合征。
⑤其他先天性畸形：十二指腸倒位、膽囊十二指腸結腸索帶所致十二指腸梗阻；十二指腸前門靜脈；法特氏壺腹位置異常（膽總管開口于十二指腸第三部）。