OP發生與性別、地域、種族和家族因素等相關。近年來對OP易感基因的關聯分析主要在以下方面:(1)調節鈣平衡的激素及其受體；(2)細胞因子、生長因子及其受體；(3)骨基質；(4)性激素及其受體；(5)其他方面。其中最受矚目的是維生素D受體(VDR)基因、雌激素受體(ER)基因以及I型膠原蛋白(CoLlA1)基因等。
VDR基因
VDR基因是OP重要的候選基因。VDR基因編碼VDR蛋白，該基因位于12q13.14染色體，包含11個外顯子，現已發現VDR基因有4個多態位點，即Bsml、Tagl、Apal和Fokl。維生素D與維生素D受體結合，進而調節鈣轉運、維持鈣穩態節骨吸收。Morrison等對澳大利亞孿生子進行研究，發現同卵雙胎(MZ)比異卵雙胎(DZ)的BMD值更接近，Morrison認為決定BMD的遺傳因素中，VDR基因中的等位基因占75%左右，可通過VDR基因多態性預測BMD。Zambrano-Morales等對土耳其144例絕經后女性進行研究，發現BsmI，TaqIandApaI三個位點的多態性與骨質疏松有相關性(RR=5.6)，但對此還有爭議，Uitterlinden等對26242例進行meta分析，結果發現Bsml、Tagl、Apal和Fokl與BMD及骨折的發生率沒有相關性。
ER基因
絕經后婦女罹患OP的主要原因是雌激素的缺乏，但個體之間BMD降低程度不同，這種不同反應與ER基因多態性有關。Nam等研究位于ER基因起始內含子區的PVull、Xbal多態性與絕經后婦女BMD之間的關系發現:Pp基因型者股骨頸、Ward三角BMD值均明顯高于pp型，pp型基因者比其他型更容易骨折(P=0.05)。同樣，Gómez等對墨西哥670例絕經后女性研究，發現ER基因標記物G2014A與OP有明顯關聯。
I型膠原蛋白(CoLlA)基因
在成骨生長與骨骼發育中，作為骨膠原構成主要成分的CoLIA發揮重要的作用。I型膠原由2條a1鏈和1條a2鏈組成，a1和a2分別由CoLIA1和CoLIA2基因編碼，現已證實CoLIA1基因突變可致低骨量、骨脆性增加。Grant等發現位于CoLIA1基因Spl結合部位的G-T多態性與BMD變化相關，該多態性是G→T突變所致，具G/G基因型婦女腰椎BMD值明顯高于G/T及T/T基因型。攜帶T等位基因者發生骨折相對危險度為2.97，顯著高于G/G基因者。Yazdanpanah等6280例白種人對比研究有相似的發現，純合子TT基因者股骨頸BMD比正常人群低3.8%(P=0.03)，椎體骨折風險增加2.3倍。然而，Hu等對1252例絕經后女性進行SNP-單核苷酸多態性分析得出不同的結論，即COL1A1和COL1A2基因多態性與骨折發生率沒有關聯。