同種移植排斥反應包括宿主抗移植物反應（host versus graft reaction,HVGR）和移植物抗宿主反應（graft versus host reaction,GVHR）。根據臨床器官移植術后發生排斥反應的時間，習慣上將其分為超急性排斥反應、急性排斥反應以及慢性排斥反應三種類型。
同種異型移植是臨床上最常見的移植類型。
1. 機體針對同種異型移植抗原的應答特點
①同種異型移植抗原通常可激活宿主體內高達2%的T細胞，從而引起強烈的免疫應答；②參與對同種異型移植抗原免疫應答的細胞，除宿主免疫細胞外，還包括來源于供者的抗原遞呈細胞（主要是DC）和淋巴細胞。因此，同種異型抗原的遞呈和識別有其特殊性。
2. 同種異型移植排斥反應的靶抗原
(1)表達于移植物細胞表面的MHC分子
(2)次要組織相容性抗原
(3)其他同種異型抗原：組織特異性抗原、血型抗原
3. 同種異型移植排斥反應的細胞學基礎
表達MHC-II類分子的過客白細胞激活CD4+T細胞，進而激活CTL細胞。